Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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