Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms