Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Fndc8Q9D2H8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Fndc8Q9D2H8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc8Q9D2H8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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