Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Pramef12Q9D2F1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Pramef12Q9D2F1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Pramef12Q9D2F1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Pramef12Q9D2F1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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