Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms