Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms