Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrbp1Q99PL5 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms