Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm20914-202ENSMUST00000188887 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4dQ99N05 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms