Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PccbQ99MN9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms