Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms