Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
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PtprtQ99M80 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PtprtQ99M80 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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PtprtQ99M80 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PtprtQ99M80 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PtprtQ99M80 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PtprtQ99M80 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PtprtQ99M80 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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PtprtQ99M80 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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PtprtQ99M80 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprtQ99M80 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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