Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp16Q99LG0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms