Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2aQ99KJ0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms