Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms