Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Ddb2Q99J79 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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