Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Smim11aQ99J19 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Smim11aQ99J19 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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