Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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