Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Stx18Q8VDS8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Stx18Q8VDS8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Stx18Q8VDS8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Stx18Q8VDS8 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Stx18Q8VDS8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Stx18Q8VDS8 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Stx18Q8VDS8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms