Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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