Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms