Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hecw1Q8K4P8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms