Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ssh3Q8K330 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ssh3Q8K330 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ssh3Q8K330 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ssh3Q8K330 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ssh3Q8K330 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ssh3Q8K330 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ssh3Q8K330 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms