Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc12Q8K2L8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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Trappc12Q8K2L8 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms