Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Abcf3Q8K268 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Abcf3Q8K268 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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