Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Rab11fip3Q8CHD8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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