Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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Ercc8Q8CFD5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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Ercc8Q8CFD5 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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Ercc8Q8CFD5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Ercc8Q8CFD5 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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