Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms