Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Usp27Q8CEG8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Usp27Q8CEG8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Usp27Q8CEG8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Usp27Q8CEG8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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