Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms