Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms