Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
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Atg4aQ8C9S8 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
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Atg4aQ8C9S8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Atg4aQ8C9S8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Atg4aQ8C9S8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Atg4aQ8C9S8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Atg4aQ8C9S8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Atg4aQ8C9S8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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Atg4aQ8C9S8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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