Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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