Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccser1Q8C0C4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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