Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm5409-201ENSMUST00000160346 698 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Psors1c2-201ENSMUST00000025273 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Mfap5-201ENSMUST00000032210 946 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Vmn1r209-201ENSMUST00000095961 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Olfr628-201ENSMUST00000098193 1553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Hmgn2-202ENSMUST00000102552 676 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm20921-201ENSMUST00000188265 652 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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