Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp38Q8BW70 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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