Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Cxcl16Q8BSU2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cxcl16Q8BSU2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcl16Q8BSU2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms