Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms