Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms