Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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