Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna12Q80SS5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms