Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rexo1Q7TT28 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rexo1Q7TT28 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rexo1Q7TT28 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms