Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms