Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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