Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf1Q6PDM2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms