Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trak1Q6PD31 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms