Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tpm4Q6IRU2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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