Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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