Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Krt40Q6IFX3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Krt40Q6IFX3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Krt40Q6IFX3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Krt40Q6IFX3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Krt40Q6IFX3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Krt40Q6IFX3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Krt40Q6IFX3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Krt40Q6IFX3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Krt40Q6IFX3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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