Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms