Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ccdc18Q640L5 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ccdc18Q640L5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ccdc18Q640L5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ccdc18Q640L5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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